Orgaanilise väetise ja bioorgaanilise väetise tooraine valikuks võib olla mitmesugune loomasõnnik ja orgaanilised jäätmed.Tootmise põhivalem varieerub sõltuvalt erinevatest tüüpidest ja toorainetest;põhilised toorained on: kanasõnnik, pardisõnnik, hanesõnnik, sea sõnnik, veise- ja lambasõnnik, põllupõhk, suhkrutööstuse filtrimuda, bagasse, suhkrupeedijäägid, destilleerija terad, ravimijäägid, furfuraali jäägid, seenejäägid, oa kook, puuvillaseemnekook, rapsikook, murusüsi jne.